研究论文

  • 溶藻弧菌二氢硫辛酰胺脱氢酶基因克隆及其生物信息学分析

    庞欢瑛;陈立明;蔡佳;汤菊芬;王蓓;吴灶和;简纪常;

    根据溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)二氢硫辛酰胺脱氢酶(dihydrolipoamide dehydrogenase,DLD)的基因序列设计1对特异性引物。PCR扩增结果显示,DLD(GenBank登录号AGK62253)全长1 428 bp,共编码475个氨基酸残基。根据推导的氨基酸序列预测其分子质量约为50.998 ku,等电点为5.51。细胞定位、SignalP 4.0、TMHMM Server 2.0和SoftBerry-Psite预测结果显示,DLD位于细胞质中,在第29至30个氨基酸之间存在信号肽,不存在跨膜区,氨基酸序列含有1个Asn-糖基化位点、5个蛋白激酶C磷酸化位点、6个酪蛋白激酶II磷酸化位点等多个活性位点。系统进化树结果显示,溶藻弧菌DLD与副溶血弧菌(V.parahaemolyticus)聚为一簇。用Kyte-Doolittle亲水性参数、Karplus-Schulz柔韧性参数、Emini表面可及性参数和Jameson-Wolf抗原性参数分别预测,DLD可能的B细胞抗原优势表位分别是第5~10、106~110、120~125、158~163和175~180区段。利用SWISS-MODEL软件,模拟DLD亚基三维结构模型,结果显示其与大肠杆菌(Escherichia coli)DLD蛋白有相似构型。Kegg分析发现,其涉及糖酵解和糖异生等9条信号通路。从生物信息学角度验证了DLD作为弧菌共同抗原的可行性。

    2014年01期 v.34 1-8页 [查看摘要][在线阅读][下载 525K]
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  • 溶藻弧菌acfA基因克隆与生物信息学分析

    程海燕;庞欢瑛;鲁义善;简纪常;吴灶和;蔡双虎;

    溶藻弧菌引起海水养殖产业弧菌病的主要病原,附着定植因子基因acfA是溶藻弧菌重要毒力基因之一,其表达产物是溶藻弧菌有效定植在宿主肠道上所必需的蛋白。根据弧菌属细菌acfA基因基因保守区设计引物,采用Touchdown PCR扩增acfA基因部分序列,Inverse PCR和Nested PCR扩增已知序列侧翼序列,成功克隆了溶藻弧菌acfA基因全长。克隆的acfA基因序列全长为743 bp,开放阅读框长度为648 bp组成,共编码215个氨基酸,在5′端上游未发现-35区和-10区序列。演绎的ACFA蛋白N端有18个氨基酸信号肽序列,表明该蛋白是分泌型蛋白;蛋白结构分析表明主要由α螺旋和不规则卷曲构成。BLAST分析表明,该蛋白氨基酸序列与其他弧菌相应蛋白同源性较高,是较保守的外膜蛋白。

    2014年01期 v.34 9-14页 [查看摘要][在线阅读][下载 375K]
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  • 高温对吉富罗非鱼幼鱼生长及超氧化物歧化酶、乳酸脱氢酶活力的影响

    杨洪帅;王辉;刘加慧;梁国栋;

    研究34℃高温环境下吉富品系罗非鱼(GIFT Oreochromis niloticus)幼鱼生长及超氧化物歧化酶(SOD)、乳酸脱氢酶(LDH)活力的变化规律,以及SOD、LDH活力与幼鱼生长间的关系。结果表明:持续高温对幼鱼特定生长率及SOD、LDH活力的影响有统计学意义(P<0.05);随着时间的延长,LDH活力显著提高,差异有统计学意义(P<0.05),特定生长率及SOD活力随时间变化不具统计学意义(P>0.05);LDH活力增强是高温条件下幼鱼特定生长率降低的原因之一。

    2014年01期 v.34 15-20页 [查看摘要][在线阅读][下载 298K]
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  • 盐度对莫荷罗非鱼幼鱼呼吸和氨氮排泄的影响

    李明昊;陈刚;黄建盛;张健东;周晖;汤保贵;王忠良;卢迈新;李瑞伟;

    将莫荷罗非鱼(Oreochromis mossambicus×O.urolepis hornorum)幼鱼养殖水体盐度从淡水渐变至12、18、24、30(每天提升6)等4个目标盐度,利用间歇式呼吸仪分析幼鱼在目标盐度下5、10、15、20 d时的呼吸和氨氮排泄的变化。结果表明,在实验前期,莫荷罗非鱼幼鱼耗氧率、排氨率随盐度的升高而增加,各盐度处理组均在5 d时升到最大值,之后开始下降,下降时间、幅度与外界盐度有关。盐度12、18组幼鱼耗氧率10 d时下降至对照组水平,20 d时低于对照组水平,差异有统计学意义(P<0.05);盐度24、30组幼鱼耗氧率则在15 d时下降至对照组水平并维持稳定;幼鱼排氨率随实验时间的延长,各盐度处理组幼鱼排氨率呈先上后下降的变化,盐度24、30组幼鱼排氨率在15 d下降并维持在对照组水平,盐度12、18组幼鱼排氨率在15 d时下降至对照组水平并于20 d时低于其他盐度组,差异有统计学意义(P<0.05)。莫荷罗非鱼幼鱼适应新盐度环境后,盐度18组的耗氧率、排氨率最低,与盐度12组差异无统计学意义(P>0.05),与其他盐度处理组有差异有统计学意义(P<0.05),推测其等渗点在盐度12~18之间。不同盐度条件下,氧氮比值介于18.810~24.216间,氨熵介于0.083~0.108间,表明莫荷罗非鱼幼鱼主要依靠蛋白质和脂肪氧化供能。

    2014年01期 v.34 21-29页 [查看摘要][在线阅读][下载 405K]
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  • 温度、盐度对卵形鲳鲹呼吸代谢的影响

    李金兰;陈刚;张健东;汤保贵;周晖;王忠良;黄建盛;施刚;初庆柱;李向明;

    运用间歇流水式呼吸仪研究卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus L.)在不同温度、盐度下呼吸代谢的变化。结果表明:在19~33℃内,随温度升高,卵形鲳鲹的耗氧率(RO)、排氨率(RN)、代谢率(REO)、排泄率(REN)均不断增大,差异有统计学意义(P<0.05),氨商(QA)与蛋白质供能比(PEP)则下降,差异有统计学意义(P<0.05),并在28~33℃组达到稳定;温度系数(Q10值)在水温由28℃升至33℃时最小,为1.59;肝糖原(LG)及乳酸(LD)均呈下降趋势,且各组LG差异均具统计学意义(P<0.05)。在盐度15~30时,随盐度增大,卵形鲳鲹RO、RN、REO、REN、QA与PEP均呈U型抛物线变化,并在盐度20~25时有最小值;LG与LD变化均不明显。在19~33℃内,卵形鲳鲹代谢水平与水温呈正相关,主要由氧化蛋白质供能,28~33℃的温度条件更利于卵形鲳鲹生长。在盐度15~30内,卵形鲳鲹代谢水平与盐度呈U型抛物线变化,主要由氧化蛋白质供能,盐度20~25利于机体储备蛋白质,即利于生长。

    2014年01期 v.34 30-36页 [查看摘要][在线阅读][下载 355K]
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  • 温度和体质量对胭脂鱼鱼种耗氧率的影响

    许勤智;周波;陈娜娜;沈正雄;樊均德;

    采用流水式的密封装置测定了胭脂鱼鱼种在18~30℃温度范围内的耗氧率,结果表明,在实验温度范围内,胭脂鱼鱼种耗氧率随温度上升逐渐升高,符合函数关系:y=-0.000 8 x2+0.044 0 x-0.438 1,R2=0.990 6。胭脂鱼鱼种耗氧率昼夜变化测定实验表明,其昼均耗氧率(0.204 2±0.011 0)mg?g-1?h-1,略低于夜均耗氧率(0.205 7±0.012 2)mg?g-1?h-1,二者差异不具统计学意义(P>0.05),表明胭脂鱼鱼种耗氧率并不存在明显的昼夜节律。在不同实验温度下,随着胭脂鱼鱼种规格的增大,其耗氧率均呈下降趋势。

    2014年01期 v.34 37-41页 [查看摘要][在线阅读][下载 308K]
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  • 盐度、pH和规格对尖紫蛤滤水率、摄食率、吸收率的影响

    黄洋;黄海立;邓乐平;孙成波;刘志刚;

    采用室内实验生态学方法对尖紫蛤的滤水率、摄食率和吸收率进行了研究。结果表明,盐度为2~18时,3种规格尖紫蛤的滤水率和摄食率先升后降,在盐度10.50~12.10内滤水率和摄食率出现最大值,最佳摄食盐度为11.41~12.10;pH在6.4~9.4时,3种规格尖紫蛤的滤水率和摄食率先升后降,在pH为8.23~8.45内滤水率和摄食率出现最大值,尖紫蛤最佳摄食的pH为8.23~8.28。尖紫蛤的吸收率与盐度的相关性不大。

    2014年01期 v.34 42-47页 [查看摘要][在线阅读][下载 315K]
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  • 马氏珠母贝4种壳色家系遗传差异的SSR分析

    白成;刘志刚;吴灶和;孙宗红;刘付少梅;

    采用6对微卫星分子标记,分析了马氏珠母贝(Pinctada martensii)白、黑、黄、红4种壳色家系的遗传结构。结果表明:4种壳色家系在6个位点的平均等位基因数为4.17,有效等位基因数为1.297~1.819;平均观测杂合度为0.083~0.212,平均期望杂合度为0.207~0.341;Shannon多样性指数为0.366~0.616;平均多肽信息(PIC)含量为0.257~0.442;4个壳色家系哈-温平衡指数均发生了极显著的偏离,4个家系间的群体再分效应的固定指数FST值为0.113~0.793;与马氏珠母贝普通养殖群体及壳色选育系F5相比,4种壳色家系之间遗传距离变大,遗传多样性降低。

    2014年01期 v.34 48-53页 [查看摘要][在线阅读][下载 268K]
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  • 九孔鲍生长性状的遗传力及其相关性分析

    胡志国;刘建勇;蒋湘;包秀凤;

    采用平衡巢式设计方法和人工授精技术,构建九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)12个半同胞家系和36个全同胞家系(每个雄鲍配3个雌鲍),分别测定每个母系生长到8月龄的全同胞个体30个后代的壳长、壳宽和体质量,应用数量遗传学的全同胞组内相关分析法,利用SPSS软件的GLM过程计算表型变量的原因方差组分,估算九孔鲍8月龄生长性状的遗传力以及性状间遗传相关和表型相关。结果表明:利用父系半同胞组内相关法估计的遗传力是九孔鲍各生长性状遗传力的无偏估计值,其中壳长、壳宽和体质量性状的狭义遗传力的估计值分别为0.285、0.264和0.343,属于中高等遗传力,显示出较高的选择育种潜力;基于父系半同胞遗传协方差组分及表型协方差分别估计的各性状间的遗传相关和表型相关表明,各性状间均表现出高的正相关,其中壳长―壳宽、壳长―体质量和壳宽―体质量性状间遗传相关的相关系数分别为0.947、0.934、0.902,表型相关的相关系数分别为0.910、0.791、0.760。经t检验,各性状间遗传相关和表型相关均有统计学意义(P<0.01)。研究表明,以任何一个生长性状为参数进行选育,均可达到改良九孔鲍生长的效果。

    2014年01期 v.34 54-59页 [查看摘要][在线阅读][下载 311K]
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  • 亚心形四爿藻生长与温度、盐度关系的构建

    刘加慧;杨洪帅;王辉;

    采用面心立方设计(CCF)研究了温度(16~32℃)和盐度(15~55)对亚心形四爿藻生长的联合效应。结果表明,温度与盐度的一次、二次效应及互作效应对亚心形四爿藻比生长速率影响都极显著(P<0.01),温度对亚心形四爿藻比生长速率的影响大于盐度。响应曲面法分析结果表明,当温度和盐度同时升高时,亚心形四爿藻比生长速率呈先上升后下降的趋势。构建亚心形四爿藻比生长速率与温度、盐度间的模型方程,模型的决定系数为0.987 3,拟合度极高;预测决定系数为0.882 4,表明可用于预测亚心形四爿藻比生长速率的变化。通过模型优化及验证实验,在温度、盐度组合为26℃/33时,亚心形四爿藻比生长速率达到最大值。

    2014年01期 v.34 60-65页 [查看摘要][在线阅读][下载 316K]
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  • 重金属Hg~(2+)、Cd~(2+)对凸加夫蛤的急性毒性效应

    严俊贤;李铭垚;李有宁;陈明强;张哲;郭华阳;冯永勤;吴开畅;

    采用静水法,对凸加夫蛤(Gafrarium tumidum)进行Hg2+、Cd2+的单一和联合急性毒性实验。在单一毒性实验中,直线回归分析法计算结果,Hg2+和Cd2+对凸加夫蛤96h的半致死浓度(LC50)分别为0.945mg.L-1和13.367mg.L-1,安全浓度(SC)分别为0.0095mg·L-1和0.1337mg·L-1,Hg2+的毒性大于Cd2+;联合毒性实验表明,Hg2+和Cd2+对凸加夫蛤的联合毒性效应为相加作用;凸加夫蛤对Hg2+和Cd2+均具有较强的耐受性,容易造成重金属富集。

    2014年01期 v.34 66-70页 [查看摘要][在线阅读][下载 286K]
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  • 中国海风能密度预报

    郑崇伟;周林;宋帅;苏勤;

    利用NCEP预报风场,对2013年3月中旬发生在中国海的一次强冷空气过程进行分析,并利用预报风场计算得到这期间的风能密度,实现"风能密度数值预报",可为风电机采集风能提供日常保障,以提高装备的采集、转换效率。结果表明,1)NCEP预报风场可以很好地刻画冷空气给中国海带来的大风过程,从曲线走势、相关系数、偏差、均方根误差、平均绝对误差等分析也发现,NCEP预报风速在中国海具有很高精度。2)冷空气影响的海域,伴有明显的大风的过程,风能密度也出现明显的增幅。冷空气影响渤海时,该海域大部分区域的风速在10 m/s以上,大值中心在16 m/s以上;风能密度基本都在1 400 W/m2以上。冷空气影响的海域容易出现10 m/s以上的大风,对应区域的风能密度基本都在1 400 W/m2以上;冷空气的边缘海域风速也在8 m/s以上,风能密度在350 W/m2以上。3)利用NCEP预报风场,对海上风电场的风速、风能密度进行预报是可行的,可为风能开发、防灾减灾提供科学依据。

    2014年01期 v.34 71-77页 [查看摘要][在线阅读][下载 2878K]
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  • 专家系统在红树林湿地鸟类鉴别中的设计与实现

    冯琼瑛;张家善;陈粤超;杨锋;

    应用计算机专家系统对红树林湿地的鸟类进行分类与鉴别。结合产生式系统体系结构,设计开发红树林湿地鸟类鉴别系统,该系统利用鸟类目科检索表与二叉树的结构相似性,构建鸟类目科检索二叉树,结合B+树和判定树学习,设计鸟类检索编码表,实现红树林湿地鸟类目科和属种的鉴别。

    2014年01期 v.34 78-82页 [查看摘要][在线阅读][下载 715K]
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综述

  • 海洋经济贝类遗传连锁图谱研究进展

    刘进;刘志刚;王辉;

    综述近10年来海洋经济贝类遗传连锁图谱的研究动态,包括建图群体的确定、分子标记的选择以及现有海洋经济贝类遗传图谱的特点,并对22张典型贝类连锁图谱从标记种类、标记密度、标记覆盖率等方面进行详尽比较,分析目前海洋经济贝类连锁图谱构建的重大突破和所面临的问题。

    2014年01期 v.34 83-90页 [查看摘要][在线阅读][下载 315K]
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  • 墨西哥湾扇贝人工养殖及遗传育种研究进展

    彭张明;刘付少梅;刘志刚;

    综述了墨西哥湾扇贝的养殖生物学、人工养殖、遗传育种等方面的研究成果,提出存在问题,并指出研究方向。

    2014年01期 v.34 91-97页 [查看摘要][在线阅读][下载 365K]
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  • 中国近海浮游植物叶绿素、初级生产力时空变化及其影响机制研究进展

    赵辉;张淑平;

    综合分析中国近海不同海域浮游植物的时空分布和季节变化特征研究,概述该海域浮游植物叶绿素和初级生产力研究。受复杂的物理环境场、生物地球化学作用等综合影响,不同海域Chl-a和初级生产力具有显著的时空变化特征:空间上,叶绿素浓度表现为近岸高离岸低、离岸海域随纬度增加呈升高趋势;时间上,大体呈现明显的季节变化特征,北部季节特征尤为明显,其中叶绿素浓度及生产力的季节最大值在南海出现在冬季,而在中国北部海域逐渐变化为春季。影响浮游植物生长的主要因素有营养盐、温度、光照、陆源输入、季风、环流、涡旋等,不同海域、不同季节浮游植物生长的限制因子有差异。另外,由于遥感数据的精度以及现场观测航次的频率较低和站位布置较为稀疏影响了上述机制的探讨,因而浮游植物生长的主要调控机制仍待进一步研究。

    2014年01期 v.34 98-104页 [查看摘要][在线阅读][下载 279K]
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