马氏珠母贝B型清道夫受体PmSR-B基因克隆与表达性分析Molecular Characterization and Expression Analysis of Pm SR-B Gene from Pearl Oyster Pinctada fucata martensii
雷超,贝伟烈,郑哲,罗少杰,王庆恒,邓岳文
摘要(Abstract):
采用c DNA末端快速扩增技术克隆获得马氏珠母贝清道夫受体基因c DNA全长序列(Pm SR-B);利用荧光定量技术检测Pm SR-B基因在各个组织中的表达量。结果表明,Pm SR-B基因c DNA序列全长1 857 bp,开放阅读框(ORF)长1 443 bp,编码480个氨基酸,5′非翻译区(5′UTR)长89 bp,3′UTR长325 bp。预测其分子质量为54.77 ku,等电点为7.94,脂溶性系数92.94,总平均亲水性-0.120,属于疏水性蛋白;不稳定指数26.37,属于稳定蛋白。氨基酸序列同源比对结果,Pm SR-B氨基酸序列与其他物种具有一定的保守性,与华贵类栉孔扇贝(Mimachlamys nobilis)SR-B的序列的相似度高达47%。荧光定量PCR检测结果,Pm SR-B在肝胰腺中表达量最高,其后依次是鳃、闭壳肌、中央膜,各组织的表达量差异具统计学意义(P<0.05)。
关键词(KeyWords): 马氏珠母贝;清道夫受体B;基因克隆;基因表达
基金项目(Foundation): 广东省海洋与渔业局科技专项(A201308A10);; 2015年广东海洋大学“海之帆-起航计划”大学生科技创新项目;2015年广东海洋大学水产学院创新项目
作者(Author): 雷超,贝伟烈,郑哲,罗少杰,王庆恒,邓岳文
参考文献(References):
- [1]FINK I R,BENARD E L,HERMSEN T,et al.Molecular and functional characterization of the scavenger receptor CD36 in zebrafish and common carp[J].Molecular Immunology,2015,63(2):381-393.
- [2]ANDERSON C,KAZANTZIS M,WANG J,et al.Dependence of Brown Adipose Tissue Function on CD36-Mediated Coenzyme Q Uptake[J].Cell Reports,2015,10(4):505-515.
- [3]LIU K,XU Y,WANG Y,et al.Developmental expression and immune role of the class B scavenger receptor cd36in zebrafish.[J].Developmental&Comparative Immunology,2016,60:91-95.
- [4]刘凯.斑马鱼CD36可与细菌及病原相关分子模式结合并受脂肪酸诱导表达[D].中国海洋大学,2014.
- [5]董占鹏.家蚕B型清道夫受体(Class B Scavenger Receptor)基因的克隆鉴定及功能研究[D].西南大学,2011.
- [6]VAN BERKEL T J,OUT R,HOEKSTRA M,et al.Scavenger receptors:friend or foe in atherosclerosis?[J].Current Opinion in Lipidology,2005,16(5):525-35.
- [7]黄茂华.家蚕基因Cameo2与CBP对叶黄素转运的功能初探[D].重庆:西南大学,2012.
- [8]章超桦,吴红棉,洪鹏志,等.马氏珠母贝肉的营养成分及其游离氨基酸组成[J].水产学报,2000,24(2):180-184.
- [9]谢嘉.芘(pyrene)胁迫对马氏珠母贝的毒理效应研究[D].海口:海南大学,2013.
- [10]温崇庆,陈燕玲,王梅芳,等.马氏珠母贝育珠细胞小片和珠核处理技术研究Ⅲ:插核手术贝伤口区弧菌类型的初步研究[J].广东海洋大学学报,2010,30(6):69-73.
- [11]李琼珍,罗帮,张立,等.术前饥饿处理对马氏珠母贝血淋巴免疫机能的影响[J].上海海洋大学学报,2014,23(4):505-512.
- [12]朱家萍.马氏珠母贝血清抗菌活性蛋白的分离纯化与鉴定[D].湛江:广东海洋大学,2015.
- [13]焦钰,杜晓东,师尚丽,等.珍珠囊发育中马氏珠母贝血清免疫因子的变化规律[J].广东海洋大学学报,2007,27(4):21-24.
- [14]张刚生.珍珠层的微结构及其中类胡萝卜素的原位研究[D].广州:中国科学院广州地球化学研究所,2000.
- [15]任晓亮.虾夷扇贝(Patinnopecten yessoensis)闭壳肌积累类胡萝卜素相关基因的筛查[D].青岛:中国海洋大学,2011.
- [16]闻海波,聂志娟,曹哲明,等.不同颜色珍珠层的三角帆蚌组织中类胡萝卜素含量的分析[J].大连海洋大学学报,2012,27(3):265-268.
- [17]董占鹏,柴春利,代方银,等.家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析[J].蚕业科学,2010,36(5):743-753.
- [18]王志新,梁海鹰,杜晓东,等.马氏珠母贝热休克蛋白HSP60基因的克隆与表达分析[J].广东海洋大学学报,2013,33(6):14-23.
- [19]郝瑞娟,郑哲,王庆恒,等.马氏珠母贝磺基转移酶Pm CHST9基因的分子特征与表达分析[J].基因组学与应用生物学,2015(11):2 387-2 394.
- [20]徐艳萍.鱼类CD36基因的组织分布、发育表达与功能研究[D].中国海洋大学,2012.
- [21]毕文杰.B-类清道夫受体和C-型凝集素在日本囊对虾先天免疫中的功能研究[D].济南:山东大学,2015.
- [22]Hoebe K,Georgel P,Rutschmann S,et al.CD36 is a sensor of diacylglycerides[J].Nature,2005,433(7025):523-527.
- [23]张敏.青岛文昌鱼一种清道夫受体基因的鉴定、进化和功能研究[D].中国海洋大学,2012.
- [24]罗少杰,闫芳,郑哲,等.马氏珠母贝基质金属蛋白酶基因MMP_17的克隆及表达分析[J].水产学报,2015,39(7):978-988.
- [25]杜丽,张巍,陆逵,等.贝类免疫机制研究进展[J].动物医学进展,2008,29(3):77-81.
- [26]李宁.虾夷扇贝橘红色闭壳肌产生的原因及其在育种中的应用[D].青岛:中国海洋大学,2009.
- [27]VOOLSTRA O,KIEFER C,MARTIN Hoehne,et al.The Drosophila class B scavenger receptor Nina D-I is a cell surface receptor mediating carotenoid transport for visual chromophore synthesis[J].Biochemistry,2006,45(45):13429-37.
- [28]SAKUDOH T,TNARUKAWA I.A CD36-related transmembrane protein is coordinated with an intracellular lipid-binding protein in selective carotenoid transport for cocoon coloration[J].Journal of Biological Chemistry,2010,285(10):7739-7751.
- [29]TSUCHIDA K,SAKUDOH T.Recent progress in molecular genetic studies on the carotenoid transport system using cocoon-color mutants of the silkworm[J].Archives of Biochemistry&Biophysics,2015,572:151-157.
- [30]LIU H,ZHENG H,ZHANG H,et al.A de novo transcriptome of the noble scallop,Chlamys nobilis,focusing on mining transcripts for carotenoid-based coloration[J].BMC Genomics,2015,16(1):1-13.
- [31]吴小芬,雷超,陈思曼,等.马氏珠母贝养殖群体两种规格个体的类胡萝卜素含量比较[J].广东海洋大学学报,2016,36(1):31-34.