基于18S-ITS1-5.8S序列的吉富罗非鱼群体遗传多样性分析Genetic Diversity of GIFT Strains of Oreochromis niloticus Based on 18S-ITS1-5.8S Sequence
袁吉贵,李爵乾,刘丽,陈增祥,张艳苹
摘要(Abstract):
运用PCR技术扩增吉富罗非鱼选育群体第20和21世代18S-ITS1-5.8S序列,分析二序列的遗传变异。结果表明,18S-ITS1-5.8S序列中,18S、内转录间隔区(ITS)1和5.8S序列分别为156、483~540、64 bp,主要变异位点位于ITS1中;基于ITS1序列的第20代吉富罗非鱼(17尾)群体内遗传距离为0.001,保守位点530个,变异位点10个,单倍型4个,单倍型多样性为0.331±0.143,核苷酸多样性为0.002,平均核苷酸差异为1.279;基于ITS1的第21代吉富罗非鱼(42尾)群体内遗传距离为0.015,6个个体存在严重碱基缺失现象,保守位点492个,变异位点49个,单倍型12个,单倍型多样性为0.638±0.083,核苷酸多样性为0.014,平均核苷酸差异为6.945。ITS序列在该两吉富罗非鱼群体中变异较小,基于ITS1序列分析的两代群体遗传多样性水平较低。
关键词(KeyWords): 吉富罗非鱼;遗传多样性;18S-ITS1-5.8S序列
基金项目(Foundation): 中央分成海域使用金支出项目(2011-2-2-09-3);; 广东省海洋渔业科技推广专项(A201308E02);; 茂名市特色农产品广东省农业科技园区(2014B020222003-8)
作者(Author): 袁吉贵,李爵乾,刘丽,陈增祥,张艳苹
参考文献(References):
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