5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化Sequence Variation and Molecular Phylogeny of Mitochondrial COI Gene Segments from Five Species of Gobiidae Family
廖健,张顺,龙水生,黄承勤,郭昱嵩,王中铎,刘楚吾
摘要(Abstract):
获得雷州半岛红树林海区5种虾虎鱼稚幼鱼的45条线粒体COI基因序列,其T、C、A、G碱基平均含量分别为29.9%、28.4%、23.9%、17.8%。45条序列共定义23个单倍型,其中检测到变异位点184个,双带缟虾虎鱼(Tridentiger bifasciatus)单倍型比例最高(80.0%),湖栖鳍虾虎鱼(Gobiopterus lacustris)单倍型比例最低(18.2%)。Kimura 2-parameter遗传距离显示,种间遗传距离为0.137 6~0.263 5,种内遗传距离为0.000 0~0.020 8。NJ进化树及ML进化树均表明,聚为5大支系的虾虎鱼类中,阿部氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius abei)与诸氏鲻虾虎鱼(M.chulae)亲缘关系最近,湖栖鳍虾虎鱼与其他4种虾虎鱼的亲缘关系稍远。基于群体内等位基因频率分布的中性检验结果表明,双带缟虾虎鱼(Tridentiger bifasciatus)、小口拟虾虎鱼(Pseudogobius masago)、阿部氏鲻虾虎鱼、诸氏鲻虾虎鱼4个群体存在大量低频等位基因位点,而湖栖鳍虾虎鱼群体以中等频率等位基因为主。
关键词(KeyWords): 虾虎鱼;线粒体;COI基因;系统进化
基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31201996);; 广东省高等学校优秀青年教师培养计划项目(Yq2013089);广东省高等学校优秀青年教师培养计划资助项目(Yq2013091)
作者(Author): 廖健,张顺,龙水生,黄承勤,郭昱嵩,王中铎,刘楚吾
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