基于近缘EST-SSR引物的企鹅珍珠贝养殖和野生群体的遗传标记Genetic Markers Studies Based on EST-SSR Primer Relative to Pteria penguin of Farming and Wild Populations
王永丽,王梅芳,王爱民,王嫣,余祥勇
摘要(Abstract):
利用近源物种马氏珠母贝的EST-SSR引物对企鹅珍珠贝DNA进行扩增,获得7对可扩增出目标条带的近缘分子标记,分析野生群体(YS)和养殖群体(YZ)企鹅珍珠贝的遗传多样性。结果显示,7个位点共获得26个等位基因;野生和养殖群体的等位基因数分别为3~5和3~4,平均期望杂合度(He)分别为0.623 5、0.496 8;平均观测杂合度(Ho)分别为0.431 8、0.302 8;HNUPM047位点的多态信息含量较低,为0.446 7,其他位点均在0.5以上,说明该遗传标记可提供比较丰富的遗传信息。表明养殖群体遗传多样性水平低于野生群体。
关键词(KeyWords): 企鹅珍珠贝;EST-SSR;遗传多样性
基金项目(Foundation): 广东省科技计划项目(2008B020800014);; 广东省海洋渔业科技推广专项项目(A200899c04);; 公益性行业(农业)科研专项(200903028)
作者(Author): 王永丽,王梅芳,王爱民,王嫣,余祥勇
参考文献(References):
- [1]毛勇,梁飞龙,余祥勇,等.不同季节的企鹅珍珠贝游离珠植核效果比较[J].海洋通报,2003,22(6):88-91.
- [2]余祥勇,王梅芳,叶富良.企鹅珍珠贝个体发生及人工育苗的研究[J].海南大学学报(自然科学版),2000,18(3):266-269.
- [3]金启增.珍珠贝种苗生物学[M].北京:海洋出版社,1992:6-11.
- [4]王爱民,阎冰,叶力,等.三个野生种群马氏珠母贝遗传多样性的RAPD分析[J].农业生物技术学报,2003,11(2):163-168.
- [5]佟广香,闫学春,匡友谊,等.马氏珠母贝微卫星快速分离及遗传多样性分析[J].海洋学报,2007,29(4):170-176.
- [6]阎冰,叶力,邓凤娇,等.马氏珠母贝与解氏珠母贝的随机扩增多态DNA分析[J].广西科学,2001,8(4):287-290.
- [7]苏天凤,蔡云川,张殿昌,等.合浦珠母贝3个养殖群体的RAPD分析[J].中国水产科学,2002,9(2):106-109.
- [8]石耀华,洪葵,郭希明,等.马氏珠母贝EST微卫星的筛选[J].水产学报,2008,32(2):174-181.
- [9]张天时,刘萍,孟宪红,等.不同对虾种间共用微卫星DNA引物的研究[J].高技术通讯,2003,13(11):80-85.
- [10]YU H,LI Q.Development of EST-SSRs in the Mediterranean blue mussel,Mytilus galloproviancialis[J].Molecular ecology notes,2007,7(6):1308-1310.
- [11]杨璞,杨爱国,刘志鸿,等.栉孔扇贝和虾夷扇贝通用微卫星引物的筛选及其在杂种鉴定中的应用[J].安徽农业科学,2008,36(19):8287-8289.
- [12]Ibarra A M,Hernandez N K,Cruz P,et al.Genetic certification of presumed hybrids of blue×red abalone(Haliotis fulgens Philippi and H.rufescens Swainson)[J].Aquacult Res,2005,36(14):1356-1368.
- [13]O’Connell M,Wright J M.Microsatellite DNA in fishes[J].Reviews in Fish biology and fisheries,1997,7(3):331-363.
- [14]林凯东,罗琛.鲤的微卫星引物对草鱼基因组分析适用性的初步研究[J].激光生物学报,2003,12(2):121-127.
- [15]LI Q,Mu D M B.Microsatellite clones in Pacific oyster Crassostea gigas:Rapid isolation and characteristic analysis[J].Oceanologia et limnologia sinica,2004,35(4):364-370.
- [16]李永强,李宏伟,高丽锋,等.基于表达序列标签的微卫星标记(EST-SSRs)研究进展[J].植物遗传资源学报,2004,5(1):91–95.
- [17]周涵韬,郑文竹.不同作物间共用SSR引物的初步研究[J].厦门大学学报(自然科学版),2002,41(1):90-93.
- [18]Xu Z,Dhar A K,Wyrzykowski J,et al.Identification of abundant and informative microsatellites from shrimp(Penaeus monodon)genome[J].Animal genetic,1999,30(2):150-156.
- [19]战爱斌,包振民,陆维,等.仿刺参的微卫星标记[J].水产学报,2006,30(2):192-196.
- [20]Mc Quown E C,Sloss B L,Sheehan R J,et al.Microsatellite analysis of genetic variation in sturgeon(Acipenseridae):new primer sequences for Scaphirhynchusand Acipenser[J].Trans Am Fish Soc,2000,129(6):1 380-1 388.
- [21]邵昭君,赵娜,朱滨,等.铲鲟微卫星引物对中华鲟的适用性研究[J].水生生物学报,2002,26(6):577-584.
- [22]全迎春,梁利群,孙效文,等.斑马鱼微卫星分子标记检测鲤鱼种间多态性[J].中国水产科学,2006,13(2):300-304.
- [23]汪桂玲,王建军,李家乐.太平洋牡蛎微卫星引物对三角帆蚌的适用性研究[J].水产学报,2006,30(1):15-20.
- [24]万俊芬,包振民,刘广绪,等.扇贝种间单对杂交一代幼虫ISSR标记的分离方式[J].高技术通讯,2004(5):82-87.
- [25]Frankham R,Ballou JD,Briscoe DA.Introduction to Conservation Genetics[M].London:Cambridge University Press,2002:29-62.
- [26]王冬群,李太武,苏秀榕.象山缢蛏养殖群体和野生群体遗传多样性的比较[J].中国水产科学,2005,12(2):139-142.
- [27]宋林生,李俊强,李红蕾,等.用RAPD技术对我国栉孔扇贝野生种群与养殖群体的遗传结构及其遗传分化的研究[J].高技术通讯,2002,7(1):83-86.
- [28]王伟,尤锋,高天翔,等.山东近海牙鲆自然和养殖群10个微卫星基因座位的遗传多样性分析[J].海洋与湖沼,2004,35(6):530-537.
- [29]Balloux F,Lugon-Moulin N.The estimation of population differentiation with microsatellite markers[J].Mol Ecol,2002,11(2):155-165.