广东海洋大学学报

2024, v.44(01) 55-63

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马氏珠母贝Perlucin基因序列特征及其SNP与耐低温性状的关系
Sequence Characteristics of Perlucin Gene in Pinctada fucata martensii and Relationship between Its SNPs and Low Temperature Tolerance

王成,赖卓欣,宋欣霖,钟如卓,郑哲,王庆恒

摘要(Abstract):

【目的】克隆马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)新的凝集素分子基因,命名为Perlucin,研究在低温胁迫下马氏珠母贝Perlucin的表达以及与抗低温性状相关的单核苷酸多态性(SNP)位点。【方法】根据马氏珠母贝基因组中Perlucin基因序列设计引物,克隆Perlucin基因全长;用生物信息学方法分析Perlucin的结构和理化特征;设计17和22℃(对照)2个温度组,对马氏珠母贝进行低温胁迫实验,用实时荧光定量PCR检测低温胁迫下Perlucin表达量的变化;筛选和比较分析马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的Perlucin外显子区的SNP位点和单倍型。【结果】马氏珠母贝Perlucin全长631 bp,编码152个氨基酸;包含1个信号肽和1个C型凝集素结构域。同源分析表明,马氏珠母贝Perlucin与紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)Perlucin的亲缘性最近。Perlucin在鳃中表达量最高,其次为足和肝胰腺。低温胁迫时,鳃组织中Perlucin基因在17℃低温组的表达量呈先升高后降低的趋势,在12 h时达到最高并显著高于22℃对照组(P <0.05),表明Perlucin可能参与马氏珠母贝的低温响应过程。对Perlucin外显子区的SNP进行分析,共得到30个SNP,其中13个SNP位点的基因型频率在R和W群体间差异显著(P <0.05)。【结论】Perlucin是参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因,筛选出两个SNP位点g.40078856、g.40078945。

关键词(KeyWords): 马氏珠母贝;Perlucin;基因克隆;低温胁迫;SNP

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 广东省自然科学基金(2023A1515030048);; 广东省普通高校重点领域专项(2020ZDZX1045);; 广东省现代农业产业技术体系-贝藻类产业创新团队项目(KJ146);; 湛江市科技计划(2022A01010)

作者(Author): 王成,赖卓欣,宋欣霖,钟如卓,郑哲,王庆恒

参考文献(References):

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