蛤蜊科3种贝类16S rRNA基因片段及ITS2核苷酸序列分析Sequence Analysis on Mitochondrial 16S rRNA Gene Fragments and ITS2 Loci in Three Species of Mactradae(Mollusca: Bivalvia)
孟学平,高如承,董志国,阎斌伦,程汉良,李艳杰,陈建安
摘要(Abstract)：
利用PCR技术分别扩增连云港及启东沿海蛤蜊科的西施舌(Coelomactra antiquata)、中国蛤蜊(Mactrachinensis)和四角蛤蜊(Mactra veneriformis)3种双壳贝的16S rRNA基因片段和ITS2核苷酸序列,测序后用DNA star软件分析了核苷酸差异。结果显示:三种贝类16S rRNA基因片段长度相同,均为306bp(去除引物),核苷酸存在多态性,共有45个变异位点,54个核苷酸发生了变异,全部为碱基置换。西施舌与中国蛤蜊此片段核苷酸的同源性为88.9%,与四角蛤蜊的同源性为88.6%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为90.6%。三种蛤蜊ITS2序列分别为390 bp(西施舌)4、41 bp(四角蛤蜊)和466 bp(中国蛤蜊),存在长度多态性,ITS2核苷酸差异分析结果显示,西施舌与中国蛤蜊的同源性为70.9%-71.1%,西施舌与四角蛤蜊的为70.5%-71.0%,中国蛤蜊与四角蛤蜊的同源性为88.1%-88.8%。ITS2序列分析结果与16S rRNA基因片段分析结果一致,2种分子分析法均显示中国蛤蜊与四角蛤蜊的亲缘关系近。
关键词(KeyWords)： 西施舌;中国蛤蜊;四角蛤蜊;16SrRNA基因;ITS2
基金项目(Foundation): 国家863计划项目资助(2004AA603140);; 江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题项目(2005HS009);; 江苏省高校自然科学研究计划项目(05SJD240028);; 淮海工学院引进人才科研启动基金资助项目(KK01050)
作者(Author): 孟学平,高如承,董志国,阎斌伦,程汉良,李艳杰,陈建安
参考文献(References)：
- [1]Deguchi R,.External Ca2+is predominantly used for cytoplas-mic and nuclear Ca2+increases in fertilized oocytes of the ma-rine bivalveMactra chinensis[J].J Cell Sci.,2003,116(Pt 2):367-76.
- [2]Deguchi R,Osanai K.Meiosis reinitiation from the first pro-phase is dependent on the levels of intracellular Ca2+and pH inoocytes of the bivalvesMactra chinensisandLimaria hakodat-ensis[J].Dev Biol.,1994,166(2)∶587-99.
- [3]Lin HP,Cho Y,Yashiro H,et al.Purification and characteriza-tion of paralytic shellfish toxin transforming enzyme fromMactra chinensis[J].Toxicon,2004,44(6),657-68.
- [4]黄艳艳,欧阳珊,吴小平,等.中国蚌科线粒体16SrRNA序列变异及系统发育[J].水生生物学报,2003,27(3):258-263.
- [5]杨建敏,郑小东,王如才,等.3种鲍16S rRNA基因片段序列的初步研究[J].青岛海洋大学学报,2003,33(1):36-40.
- [6]张亮,黄艳艳,刘焕章.利用mtDNA 16S rRNA序列差异鉴定江西青岚湖的河蚌种[J].水生生物学报,2004,23(3):294-299.
- [7]Zheng Xiaodong,Wang Rukai,Xiao Shu,et al.Genetic diversityin population ofSepiella maindroniusing 16S rRNA gene se-quence analysis[J].High technology letters,2003,9(1):1-5.
- [8]李悦,吴敏,王秀玲.小鲵科线粒体16S rRNA基因序列分析及其系统发育[J].动物学报,2004,50(3):464-469.
- [9]郭宪光,张耀光,何舜平,等.16S rRNA基因序列变异与鮡科鱼类系统发育[J].科学通报,2004,49(14):1371-1379.
- [10]Barucca M,Olmo E,Schiaparelli S,et al.Molecular phyloge-ny of the family Pectinidae(Mollusca:Bivalvia)based on mi-tochondrial 16S and 12S rRNA genes[J].Mol PhylogenetEvol,2004,31(1):89-95.
- [11]Canapa A,Barucca M,Marinelli A,et al.Molecular datafrom the 16S rRNA gene for the phylogeny of Pectinidae(Mollusca:Bivalvia)[J].J Mol Evol,2000,50(1):93-97.
- [12]Barucca M,Olmo E,Schiaparelli S,et al.Molecular phylogenyof the family Pectinidae(Mollusca:Bivalvia)based on mito-chondrial 16S and 12S rRNA genes[J].〗Mol PhylogenetEvol,2004,31(1)∶89-95.
- [13]喻达辉,朱嘉濠.珠母贝属的系统发育∶核rDNA ITS序列证据[J].生物多样性,2005,13(4)∶315-323.